| | Pos | No | Name | Nat | Team | Type | Engine | Best Time | Lap | Gap | | Ave. km/h |
| | 1 | 36 | アンドレ・ロッテラー | GER | PETRONAS TEAM TOM'S | FN06 | RV8J | 1'40.301 | 2 / 4 | | | 163.775 |
| | 2 | 1 | 松田 次生 | JPN | LAWSON TEAM IMPUL | FN06 | RV8J | 1'40.461 | 3 / 5 | 0.160 | 0.160 | 163.514 |
| | 3 | 47 | ロニー・クインタレッリ | ITA | CERUMO/INGING | FN06 | RV8J | 1'40.639 | 2 / 5 | 0.338 | 0.178 | 163.225 |
| | 4 | 4 | ジョアオ・パオロ・デ・オリベイラ | BRA | KONDO RACING | FN06 | RV8J | 1'40.873 | 2 / 5 | 0.572 | 0.234 | 162.846 |
| | 5 | 41 | 土屋 武士 | JPN | DoCoMo TEAM DANDELION RACING | FN06 | HF386E | 1'40.889 | 2 / 5 | 0.588 | 0.016 | 162.821 |
| | 6 | 32 | 小暮 卓史 | JPN | PIAA NAKAJIMA RACING | FN06 | HF386E | 1'41.086 | 4 / 5 | 0.785 | 0.197 | 162.503 |
| | 7 | 3 | 横溝 直輝 | JPN | KONDO RACING | FN06 | RV8J | 1'41.119 | 2 / 5 | 0.818 | 0.033 | 162.450 |
| | 8 | 20 | リチャード・ライアン | GBR | TP Checker IMPUL | FN06 | RV8J | 1'41.233 | 2 / 5 | 0.932 | 0.114 | 162.267 |
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***** 以上Q3選抜車両 *****
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| | 9 | 8 | 石浦 宏明 | JPN | Team LeMans | FN06 | RV8J | 1'41.676 | 3 / 5 | 1.375 | 0.443 | 161.560 |
| | 10 | 31 | ロイック・デュバル | FRA | PIAA NAKAJIMA RACING | FN06 | HF386E | 1'41.848 | 3 / 4 | 1.547 | 0.172 | 161.287 |
| | 11 | 2 | ブノワ・トレルイエ | FRA | LAWSON TEAM IMPUL | FN06 | RV8J | 1'41.958 | 6 / 6 | 1.657 | 0.110 | 161.113 |
| | 12 | 7 | 本山 哲 | JPN | Team LeMans | FN06 | RV8J | 1'41.982 | 4 / 5 | 1.681 | 0.024 | 161.075 |
| | 13 | 56 | 伊沢 拓也 | JPN | AUTOBACS RACING TEAM AGURI | FN06 | HF386E | 1'41.991 | 5 / 6 | 1.690 | 0.009 | 161.061 |
| | 14 | 55 | 井出 有治 | JPN | AUTOBACS RACING TEAM AGURI | FN06 | HF386E | 1'42.097 | 3 / 6 | 1.796 | 0.106 | 160.894 |
| | 15 | 40 | 松浦 孝亮 | JPN | DoCoMo TEAM DANDELION RACING | FN06 | HF386E | 1'42.274 | 4 / 5 | 1.973 | 0.177 | 160.616 |