| 2006 / 3 / 31 | |
| Fuji International Speedway(4,563m) | Weather : 晴れ Ground : ドライ |
| Pos | No | Name | Nat | Team | Type | Engine | Best Time | Gap | Ave. km/h | Lap | |
| 1 | 1 | エイドリアン・スーティル | GER | DHG TOM'S F305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'35.849 | 171.382 | 24 / 25 | ||
| 2 | 10 | 塚越 広大 | JPN | Honda 無限 F107 | DOME F107 | MF204C | 1'36.010 | 0.161 | 0.161 | 171.095 | 25 / 25 |
| 3 | 36 | 大嶋 和也 | JPN | TDP TOM'S F305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'36.019 | 0.170 | 0.009 | 171.079 | 26 / 27 |
| 4 | 2 | 伊沢 拓也 | JPN | Honda・戸田FIGHTEX | DOME F107 | MF204C | 1'36.655 | 0.806 | 0.636 | 169.953 | 26 / 26 |
| 5 | 37 | 安岡 秀徒 | JPN | TDP TOM'S F305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'36.797 | 0.948 | 0.142 | 169.704 | 27 / 29 |
| 6 | 3 | ジョニー・リード | NZL | INGING F306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'36.925 | 1.076 | 0.128 | 169.479 | 21 / 24 |
| 7 | 12 | ファビオ・カルボーン | BRA | ThreeBond | DALLARA F3 | SR20VE | 1'37.019 | 1.170 | 0.094 | 169.315 | 11 / 24 |
| 8 | 4 | ロベルト・ストレイト | BRA | INGING F306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'37.038 | 1.189 | 0.019 | 169.282 | 12 / 13 |
| 9 | 75 | 池田 大祐 | JPN | EMS F306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'37.283 | 1.434 | 0.245 | 168.856 | 20 / 25 |
| 10 | 33 | 石浦 宏明 | JPN | 広島トヨタDALLARAF305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'37.393 | 1.544 | 0.110 | 168.665 | 24 / 24 |
| 11 | 14 | マルコ・アスマー | EST | ThreeBond | DALLARA F3 | SR20VE | 1'37.423 | 1.574 | 0.030 | 168.613 | 26 / 28 |
| 12 | 62 | 嵯峨 宏紀 | JPN | DENSO・ルボーセF306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'37.597 | 1.748 | 0.174 | 168.313 | 23 / 24 |
| 13 | 74 | 岡田 暁 | JPN | EMS F306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'38.507 | 2.658 | 0.910 | 166.758 | 25 / 26 |
| 14 | 50 | 磯崎 元彦 | JPN | GOLDON ZAP F305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'38.699 | 2.850 | 0.192 | 166.433 | 16 / 18 |
| Start Time : 15:02'01 | Finish Time : 15:58'29.892 | Entry:14 Start:14 Finish:14 |