| 2006 / 3 / 31 | |
| Fuji International Speedway(4,563m) | Weather : 晴れ Ground : ドライ |
| Pos | No | Name | Nat | Team | Type | Engine | Best Time | Gap | Ave. km/h | Lap | |
| 1 | 4 | ロベルト・ストレイト | BRA | INGING F306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'36.998 | 169.352 | 10 / 22 | ||
| 2 | 36 | 大嶋 和也 | JPN | TDP TOM'S F305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'37.198 | 0.200 | 0.200 | 169.003 | 19 / 27 |
| 3 | 1 | エイドリアン・スーティル | GER | DHG TOM'S F305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'37.226 | 0.228 | 0.028 | 168.955 | 10 / 26 |
| 4 | 10 | 塚越 広大 | JPN | Honda 無限 F107 | DOME F107 | MF204C | 1'37.393 | 0.395 | 0.167 | 168.665 | 25 / 25 |
| 5 | 37 | 安岡 秀徒 | JPN | TDP TOM'S F305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'38.003 | 1.005 | 0.610 | 167.615 | 10 / 28 |
| 6 | 2 | 伊沢 拓也 | JPN | Honda・戸田FIGHTEX | DOME F107 | MF204C | 1'38.044 | 1.046 | 0.041 | 167.545 | 24 / 25 |
| 7 | 33 | 石浦 宏明 | JPN | 広島トヨタDALLARAF305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'38.060 | 1.062 | 0.016 | 167.518 | 10 / 25 |
| 8 | 14 | マルコ・アスマー | EST | ThreeBond | DALLARA F3 | SR20VE | 1'38.154 | 1.156 | 0.094 | 167.357 | 23 / 24 |
| 9 | 12 | ファビオ・カルボーン | BRA | ThreeBond | DALLARA F3 | SR20VE | 1'38.177 | 1.179 | 0.023 | 167.318 | 16 / 22 |
| 10 | 74 | 岡田 暁 | JPN | EMS F306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'38.432 | 1.434 | 0.255 | 166.885 | 10 / 24 |
| 11 | 3 | ジョニー・リード | NZL | INGING F306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'38.731 | 1.733 | 0.299 | 166.379 | 16 / 22 |
| 12 | 75 | 池田 大祐 | JPN | EMS F306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'38.779 | 1.781 | 0.048 | 166.299 | 7 / 18 |
| 13 | 62 | 嵯峨 宏紀 | JPN | DENSO・ルボーセF306 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'38.890 | 1.892 | 0.111 | 166.112 | 10 / 25 |
| 14 | 50 | 磯崎 元彦 | JPN | GOLDON ZAP F305 | DALLARA F3 | 3S-GE | 1'40.624 | 3.626 | 1.734 | 163.249 | 6 / 22 |
| Start Time : 11:09'37 | Finish Time : 12:03'09.390 | Entry:14 Start:14 Finish:14 |